De actie vindt plaats in Moskou in 1584 en begint een ruzie in de Boyarsky Doema: Mikhail Nagoy, de broer van Tsarina Maria Fedorovna, pleit voor een plaats bij Saltykov en trekt de overgebleven boyars in swara. Zakharyin-Yuriev, de broer van de vrouw van de eerste tsaar, breekt geschillen af ​​en praat over het belang van het verzamelen van hun zaak: John, gekweld door wroeging na de moord op zijn zoon, besloot de monastieke rang te nemen en droeg de Doema op om een ​​opvolger te kiezen. Ondertussen "vechten vijanden van alle kanten tegen Rusland", het is pestilentie en hongersnood. Prins Mstislavsky spreekt in zijn beslissing over de taaiheid van de koning. Nagoya biedt de jonge Dmitry Tsarevich aan met de koningin en, indien nodig, de 'heerser', die hij bereid is te zijn; Sitsky - Zakharyin, die zichzelf met niets heeft gekleurd. Zakharyin spreekt voor Ivan Petrovich Shuisky, die nu in het belegerde Pskov zit.

De koning is echter onmiddellijk nodig. Zakharyin vraagt ​​Godunov om advies, die zich niet op plaatsen heeft gevestigd en bescheiden beneden is gaan zitten. Hij beschreef in detail de niet benijdenswaardige positie van de staat, spreekt over de onmogelijkheid om op zo'n moment van koning te veranderen en roept de boyars op om John te vragen op de troon te blijven. Sitsky herinnert zich de gruweldaden van de tsaar en probeert tevergeefs de boyars te stoppen. Ze gaan naar de tsaar en beslissen onderweg wie er zal spreken, en schuchtere soevereine woede. Godunov neemt het risico. John, al gekleed in een zwarte soutane, heeft de hoed van Monomakh verwijderd, wacht in de slaapkamer op de beslissing van de boyars en klaagt over de herinnering aan de laatste schurk. Er komt een boodschapper uit Pskov, die de tsaar in eerste instantie verwijst naar de 'nieuwe heer', maar dan hoort hij dat het nieuws vreugdevol is en hoort hij een verhaal over de weerspiegeling van de aanvallen en Batur's terugtrekking uit Pskov. Hij ontvangt een brief van Kurbsky, waarin hij de tsaar een onhandige lettergreep verwijt, dreigt met de snelle verovering van Pskov, veel van de gruweldaden van John noemen de oorzaak van zijn huidige nederlagen en herinneren zich venijnig aan zijn ontslag. John is woedend, want omdat hij alle familieleden van Kurbsky heeft vernietigd, is hij machteloos om zijn verdriet op iemand te nemen. De boyars komen, die de koning geïrriteerd ontmoet. Na naar een korte toespraak van Godunov te hebben geluisterd, zet hij de hoed van Monomakhov op, verwijt de jongens die hem daartoe hebben gedwongen, en kust Godunov, die moedige en brutale toespraken hield 'voor het welzijn van de staat'. De afwezigheid van Sitsky blijft niet onopgemerkt en de tsaar, die niet naar de voorbidders wil luisteren, beveelt de executie.

In de koninklijke kamers van Goduns wacht Zakharyin op John, en Godunov zegt dat de koning, die van de koningin wil scheiden, de nicht van de Engelse koningin nastreeft. De verontwaardigde Zakharyin vraagt ​​hoe John Godunov probeerde te weerhouden, en krijgt het antwoord dat hij John alleen op een rotonde kan beïnvloeden. John komt binnen en bericht over de rel in de Poolse troepen bij Pskov en over de verwachting van een ambassadeur uit Warschau, die naar zijn mening gestuurd is om vrede te vragen. Hij beveelt Zakharyin om de mensen over deze boodschap te informeren. Hij vertelt Godunov om met de Engelse ambassadeur de voorwaarden voor het aanstaande huwelijk te bespreken. Hij probeert voorbede te doen voor de koningin en krijgt een boze berisping vol bedreigingen. Alleen gelaten, verwijt Godoenov zichzelf de betoonde vriendelijkheid en weigert het geweten de voorkeur te geven boven de zaak. In het huis van Vasily Ivanovich Shuisky spannen de jongens Mstislavsky, Belsky en de gebroeders Nagoy samen om Godunov te vernietigen. Ze besluiten, gebruik makend van de irritatie van de mensen, om Godunov alle problemen te verwijten, en Shuisky biedt Michail Bityagovsky aan om het plan te vervullen. Hij verbindt zich ertoe het volk in opstand te brengen en hem ertoe aan te zetten te doden. Belsky stelt voor om Prokofy Kikin hiervoor te sturen. Godunov komt. De gasten verspreiden zich haastig. Godunov klaagt bij Shuisky dat hij niet geliefd is in de Doema, Shuisky verzekert hem van zijn gezindheid en steun en vertrekt, plotseling opgeroepen door de tsaar. Godunov, alleen gelaten met Bityagovsky, ontdekt zijn perfecte kennis van zijn bedoelingen en, hem bedreigend met ongekende executies, stuurt hem naar dezelfde pleinen om het volk te overtuigen tegen Shuisky en Belsky, die de koning willen "vergiftigen met vergif".

Ondertussen beveelt de tsarina de moeder van de tsarevitsj niet om iemand anders naar hem toe te laten komen, en vooral Godoenov, ze vertrouwt alleen Nikita Romanovitsj Zakharyin. Zakharyin komt. De koningin vertelt hem over de geruchten in het paleis en vraagt ​​of haar vermoeden niet waar is dat de koning haar bij Demetrius wil achterlaten. Zakharyin vraagt ​​haar om klaar te zijn voor alles, de tsaar mag Godoenov niet tegenspreken en vertrouwen. John komt met Godunov en wacht tot de koningin zich verkleedt, luistert naar de omstandigheden van de Engelse ambassadeur en vraagt ​​naar de Polen die na Garaburd zijn aangekomen, zich afvragend wat Polen belooft voor vrede, en niet wil luisteren naar de angsten over het doel van deze ambassade. De koningin die is binnengekomen, kondigt de aanstaande scheiding aan. afgezwakt belooft Dimitri de erfenis van de UGLICH en bedreigt hem, na de voorspraak van Zakharyin te hebben gehoord, met executie. In de troonzaal ontvangt John de Poolse ambassadeur in Garaburda. De eisen van Batur zijn zo vernederend (om Smolensk, Polotsk, Novgorod en Pskov uit het Livonian-regiment te halen en Polen aan Polen te geven) dat de tsaar, met een algemeen gemompel, in woede uitbarst en, na de uitnodiging van de Poolse koning voor vechtsporten te hebben gehoord, op jacht gaat naar zijn ambassadeur met honden en hem gaat gooien bijl. Garaburda merkt op dat John het nieuws niet kent over het verpletteren van de Russische regimenten aan de grens, over het feit dat de Zweden Narova innemen en hun gezamenlijke campagne met Batur in Novgorod, en nadat ze John een ontmoeting met de koning in Moskou hebben beloofd, vertrekt hij. Godunov, die binnenkwam, bevestigt alle berichten van Garaburda, maar de tsaar beveelt valse boodschappers op te hangen en overwinnende gebeden in alle kerken.

Op het plein in Zamoskvorechye is de menigte bezorgd voor het pakhuis, verontwaardigd over de broodprijs, de deurwaarders die steekpenningen aannemen en het feit dat de koning de overtreders niet terechtstelt. Kikin verschijnt, gekleed als een vreemde, geeft Godunov de schuld en verwijst naar Gods teken, "een bloederige, staartstaart". Hij zegt dat hij een wonder zag in Kiev: het Sophia-kruis in brand en een stem die oproept tot Godunov om op te staan. Stemmen ter verdediging van Godunov worden gehoord, stemmen die roepen om de verdedigers te verslaan, en tot slot de stem van Bityagovsky, die wijd open staat in de kaftan met een verwijderd nummer. Hij zegt dat Shuisky en Belsky de koning zouden vergiftigen, maar Godunov gooide de vergiftigde cake naar de hond. Wanneer Bityagovsky perplex staat over een zwerver die een wonder heeft gezien, noemt hij hem bij zijn naam en zegt dat hij met opzet is gestuurd. Grigory Godunov verschijnt en kondigt aan dat Boris Godunov alle voorraden uit zijn eigen schatkist opkoopt en morgen non-cash zal uitdelen. De mensen rennen naar Kikin. In de koninklijke kamers kijken de koningin, de zus van Godunov, Irina en zijn vrouw, Maria, naar de komeet. De koning kijkt haar vanaf de veranda aan. De wijze mannen en tovenaars werden gebracht om te ontrafelen waar de komeet voor was. John verschijnt en verklaart het teken te hebben begrepen: de komeet kondigt zijn dood aan. Hij vraagt ​​om vergeving van de koningin en, omdat hij precies het tijdstip van de dood wil weten, om niet zonder berouw te sterven, doet hij een beroep op de magiërs. Ze noemen Kirillin-dag. Op verzoek van tsaar Godoenov leest hij de synode voor, waar zijn slachtoffers vermeld staan, vult John de lijst aan. Een butler komt uit Sloboda aan met de boodschap dat het paleis op een winterdag door een blikseminslag is afgebrand. Geschokt vraagt ​​John iedereen om vergeving, bidt hartstochtelijk en vraagt ​​Fedor hoe hij gaat regeren, maar Fedor vraagt ​​iemand anders in het koninkrijk te zetten. Ze brengen twee brieven: over de nadering van de Khan naar Moskou en de opstand rond Kazan. Ze brengen een schemnik mee die dertig jaar in afzondering heeft geleefd. John, die met rust wordt gelaten, spreekt over de tegenslagen die Rusland zijn overkomen en vraagt ​​advies. Het schema roept veel mensen op die de vijand kunnen weerstaan ​​- ze worden allemaal vernietigd door de koning. Hij spreekt over de prins, maar de prins is dood. John leidt de schemer en dwingt de boyars van Mstislavsky, Belsky, Zakharyin en Godunov het kruis te kussen in de zin dat ze Fedor zullen dienen, en de vijfde benoemt Ivan Petrovich Shuisky als hij in de buurt van Pskov overleeft. Hij stuurt ambassadeurs naar Litouwen om vrede met Batur te sluiten onder de meest vernederende omstandigheden, in de overtuiging dat Batur na zijn dood nog meer zal eisen, en met zijn ongehoorde vernedering wenst hij boete te doen voor zonden.

In Cyril is de koningsdag beter. Godunov roept in het geheim de heksen en ze zeggen dat de dag nog niet voorbij is. Godunov wordt voorspeld door de keizerlijke troon, de drie sterren die hem scheiden van de grootheid van de ster en zijn belangrijkste mysterieuze tegenstander worden herdacht ("zwak, maar krachtig - onschuldig, maar schuldig - niet zichzelf", "gedood, maar levend"). Dr. Jacobi komt aan en antwoordt Godoenov dat de tsaar moet worden beschermd tegen irritatie, en daarom noemde Belsky de hansworsten. Godunov accepteert Bityagovsky en komt erachter dat de mensen verbitterd zijn tegen Shuisky en Belsky. Ondertussen onderzoekt John de schatten, op zoek naar cadeautjes voor de Engelse koningin en bruid, een nar draait rond de koning, buffels in de aangrenzende kamers wachten op een bord. De volgende dag benoemt de tsaar de executie van de wijzen en stuurt Boris om dit aan hen bekend te maken. Hij is triomfantelijk, maar achterdochtig en vatbaar voor irritatie; Na met Belsky te hebben gezeten, laat de koning vallen. Godoenov keert terug en, nadat hij de koning met betekenisvolle stilte tot waanzin heeft geleid, kondigt hij het antwoord van de wijzen aan dat hun wetenschap betrouwbaar is en dat Kirillin de dag nog niet voorbij is. In woede noemt John Godunov een verrader, beschuldigt hem van een aanslag op zijn leven, roept de beulen en valt. Algemene verwarring. De koning roept de biechtvader, de boyars - dokters, die per ongeluk buffels gebruiken. John gaat dood. De mensen op het plein schreeuwen dat de koning werd lastig gevallen door Shuisky en Belsky, en de verbijsterde Fedor vertrouwt Godunov uitleg toe. Godunov stuurt de boyars in ballingschap, Mstislavsky, die, samen met Nagy, Bityagovsky de problemen beschuldigt, het klooster Nagih - in de UGLICH samen met Tsaritsa en Demetrius. Fedor omhelst Godunov. De mensen op het plein prijzen beide.